Las investigaciones arqueológicas coordinadas por Francisco Burillo Mozota se centran en tres ámbitos:

1. La aplicación de la Arqueología Espacial y el modelo de sociedad campesina a los celtíberos.

2. Proyecto Segeda, con descubrimiento de diferentes casas que muestran la diferenciación social existente hasta su desaparición en el año 153 a.C.: desde las viviendas más humildes de 48 m2 a la casa de patio central de 283 m2 de origen siciliano. La aparición de un lagar indica la producción de vino y la de una gran plataforma, la existencia de rituales relacionados con el ocaso solar. Se realizan las festividades históricas de los Idus y la Vulcanalia, declaradas de Interés Turístico, junto con los programas didácticos y de arqueología experimental.

3. Desde el 2011 se desarrolla el Proyecto Serranía Celtibérica, lo que ha permitido visibilizar el mayor desierto demográfico de Europa por despoblación y generar estrategias para su desarrollo.